// Записываем пустой набор записей, чтобы очистить ресурс
НаборЗаписей.Записать();
В этом коде замените ИмяВашегоРегистра на имя вашего регистра сведений, а ВашеЗначение на значение, по которому вы хотите произвести отбор (если это необходимо). Если вы хотите очистить все записи, просто создайте набор записей без отбора.
Таким образом, все записи, соответствующие установленным условиям, будут замещены пустым набором записей, и ресурс будет очищен.
Если у вас есть дополнительные вопросы, не стесняйтесь спрашивать!