Ошибка заключается в том, что обе команды имеют одинаковое имя («КоммерческоеПредложение3»). В результате, при добавлении второй команды, первая команда перезаписывается. Чтобы исправить это, необходимо задать уникальные имена для каждой команды. Например:
1C ДобавитьКоманду(ТаблицаКоманд, "Коммерческое предложение (для запроса ценовых предложений)", "КоммерческоеПредложение1", "ВызовСерверногоМетода", Истина, "ПечатьMXL"); ДобавитьКоманду(ТаблицаКоманд, "Коммерческое предложение (для запроса ценовых предложений с характеристиками)", "КоммерческоеПредложение2", "ВызовСерверногоМетода", Истина, "ПечатьMXL");
Таким образом, каждая команда будет иметь уникальное имя, и обе появятся в документе.