Как ограничить распределение в 1С:ЗУП КОРП только на окладные выплаты?

Да, именно так и делают.

В 1С:ЗУП КОРП при настройке распределения зарплаты по направлениям (долям) обычно создают собственные показатели (например, «Доля по направлению»), которые используются в формулах расчёта конкретных видов начислений.

Чтобы ограничить распределение только на определённые выплаты (например, только на оклад), нужно:

1. Создать отдельные виды начислений для оклада, отпускных, больничных и т.п.
Обычно так и сделано в типовой конфигурации.

2. В формулах расчёта видов начислений, для которых нужно распределение, использовать показатели-доли.
Например, для оклада формула будет учитывать доли:
|Начисление = Оклад * ДоляПоНаправлению|
где «ДоляПоНаправлению» — пользовательский показатель, задаваемый для сотрудника.

3. Для видов начислений, на которые распределение не нужно (отпускные, больничные и др.), в формулах не использовать эти показатели-доли.
Тогда они будут рассчитываться по стандартным правилам (например, исходя из среднего заработка), без распределения по направлениям.

4. В бухгалтерском и управленческом учёте такие начисления будут отражаться без аналитики по направлениям, так как формулы не учитывают доли.

—

Таким образом, ограничение распределения достигается именно через использование или неиспользование показателей-долей в формулах расчёта видов начислений.

—

Если же распределение делается через доработку алгоритма расчёта зарплаты (например, в обработчиках), то в коде нужно добавить проверку вида начисления:

—

Это самый простой и надёжный способ, чтобы распределение применялось только к нужным видам начислений, а остальные начисления шли по стандарту.

—

Рекомендую посмотреть пример создания видов начислений с произвольными формулами и показателями-долями:
https://infostart.ru/public/302902/

Там подробно описано, как создавать показатели и использовать их в формулах для распределения зарплаты.